Linux主要被用作服务器的操作系统，因为它的廉价、灵活性及Unix背景。传统上，以Linux为基础的“LAMP（Linux，Apache，MySQL，Perl/PHP/Python的组合）”技术，除了已在开发者群体中广泛流行，它提供网站服务供应商最常使用的平台。

基于其低廉成本与高度可设置性，Linux常常被应用于嵌入式系统，例如机顶盒、移动电话及移动装置等。在移动电话上，Linux已经成为Symbian OS的主要竞争者；而在移动装置上，则成为Windows CE与Palm OS外之另一个选择。TiVo数码摄影机使用了经过客制化后的Linux。此外，有不少硬件式的网络防火墙及路由器，例如部份LinkSys的产品，其内部都是使用Linux来驱动、并采用了操作系统提供的防火墙及路由功能。

采用Linux的超级电脑亦愈来愈多，根据2008年11月的TOP500超级电脑列表，现时世上最快速的超级电脑使用Linux作为其操作系统。而在表列的500套系统里，采用Linux为操作系统的，占了439组（即87.8%）。

2006年开始发售的SONY PlayStation 3亦可使用Linux的操作系统，它有一个能使其成为一个桌面系统的Yellow Dog Linux。之前，Sony亦曾为他们的PlayStation 2推出过一套名为PS2 Linux的DIY组件。Ubuntu自9.04版本，恢复了PPC支持（包括PlayStation 3）。

而随着OLPC的XO-1，华硕的Eee PC等低价电脑的推行，许多人乐观的认为在低端PC市场，linux的市场占有率正在快速的增长。但在Windows进入此一市场后，Linux的市占率快速下滑。现在Windows系统在所有的PC市场中，都占有绝对优势。　

主要用途：虚拟化，数据库服务器，Web服务器，应用服务器，跳转盒(Jump box)，日志服务器，开发平台，Google搜索设备，入侵检测系统。